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中国科学院为调整和加强神经科学研究力量，1999年11月在上海正式建立神经科学研究所。2014年依托研究所成立“中国科学院脑科学卓越创新中心”是中科院首批4个卓越中心之一；2015年6月扩展为“中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心”（以下简称“脑智卓越中心”），成为国际上第一个脑科学与类脑研究交叉融合的科研机构。学术主任蒲慕明教授是国际著名的神经科学家，在国际神经科学界享有很高的威望。他是神经轴突生长和突触可塑性研究的国际权威，其研究工作在Nature 、Science杂志上发表论文三十几篇。脑智卓越中心的宗旨是建立一个现代化研究所的机制，提供一个有助于严谨科研工作，高效科研产出，良性科研合作的环境，实现以业绩为准的激励和资助评估系统，以及为研究生和博士后提供高质量的专业训练。 脑智卓越中心已组建了56个研究组，每个研究组由不超过五名的工作人员与数目不等的研究生和博士后组成。许多研究组与国内外的同行有合作研究，长期合作者被聘为客座研究员。中国科学院、国家科技部、基金委等对脑智卓越中心的资助，使脑智卓越中心研究人员的经费和仪器设备已达到国际前沿机构的水平。由著名神经科学家组成的国际顾问委员会和评审委员会，定期为脑智卓越中心的体制机制、科研工作提供建议，对提高脑智卓越中心的整体科研水平起了积极的推动作用。 脑智卓越中心致力于神经科学基础研究的各个领域，包括分子、细胞和发育神经生物学、系统和认知神经科学科学、以及脑疾病机理和诊治手段研发。 脑智卓越中心已在Science、Nature、Cell、 Nature Neuroscience、 Nature Cell Biology、 Neuron、 PNAS、 The Journal of Cell Biology、J. Neuroscience等国际一流学术刊物发表一系列重要成果。 * 《基于体细胞核移植技术成功克隆出猕猴》入选2018年中国科学十大进展 * 《构建出世界首个非人灵长类自闭症模型》入选2016年中国科学十大进展 * 《神经疾病靶点研究》荣获2015年中国科学院“十二五”标志性重大进展 * 《神经突触形成新机制的研究》荣获2014年国家自然科学二等奖 * 《星形胶质细胞多巴胺D2受体通过αB晶状体球蛋白抑制神经炎症》入选2013年中国科学十大进展 * 《神经发育与可塑性研究集体》荣获2011年中国科学院杰出科技成就奖 * 《胶质细胞新功能的研究》荣获2010年国家自然科学二等奖 * 全国百篇优秀博士学位论文奖9名 * 中国科学院优秀博士学位论文奖32名 * 上海市研究生优秀成果（学位论文）21名 * 吴瑞奖学金13名 * 中国科学院院长特别奖21名、优秀奖42名 脑智卓越中心博士生培养的目标是德、智、体全面发展，在本学科内掌握坚实宽广的基础理论和系统深入的专门知识，具有独立从事科学研究工作的能力，在本学科或专门技术上做出创造性成果的高级科学技术人才，学制三年。2025年预计招收44名博士生（含转博生和统考博士生），其中预计招收统考博士生2名。实际招生人数以教育部下达的招生指标为准。